سنتز و ساختار بلوری ترکیب آدنینیوم بیس (پیریدین-2،6-دی‌کربوکسیلاتو) کرومات (III)، پیریدین-2،6-دی‌کربوکسیلیک اسید تتراهیدرات

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشگاه تهران

2 دانشگاه پارما

چکیده

در این پژوهش، ترکیب سوپرامولکولی جدید آدنینیوم بیس(پیریدین-6،2-دی­کربوکسیلاتو) کرومات (III) پیریدین-6،2-دی­کربوکسیلیک اسید تترا هیدرات (AdH+)[Cr(pydc)2](H2pydc).4H2O (1) که Ad و H2pydc به ترتیب لیگاندهای آدنین و پیریدین-6،2-دی کربوکسیلیک اسید هستند، به روش انتقال پروتون سنتز و ساختار بلوری آن به وسیله­ی تکنیک بلورشناسی با پرتو X تعیین شد. این ترکیب در سیستم بلوری راستگوشی و گروه فضایی Pbca متبلور شده است و پارامترهای یاخته یکه آن (14) 180/14a= ،(12) 036/13b=، (3) 98/33 c=آنگستروم و زوایا 90 درجه هستند. مقدار R نهایی برای 2523 بازتاب مستقل 053/0 است. واحد بی­تقارن از سه جزء آنیونی و کاتیونی و خنثی تشکیل شده است. جزء آنیونی کمپلکسی از یون Cr(III) و دو واحد پیریدین-6،2-دی­کربوکسیلات و جزء کاتیونی یک مولکول آدنین پروتونه است. جزء خنثی یک واحد مولکول پیریدین-6،2-دی­کربوکسیلیک اسید است و چهار واحد مولکول آب تبلور نیز وجود دارد. هر کمپلکس فلزی کروم(III) در ترکیب مورد بررسی دارای آرایش هشت وجهی انحراف یافته در نتیجه اتصال سه دندانه دو لیگاند پیریدین-6،2- دی­کربوکسیلات به فلز مرکزی است. وجود برهم­کنش­های بین­مولکولی و غیرکووالانسی باعث ایجاد ساختارهای خود انباشته منسجم می­شود. پیوندهای هیدروژنی و انباشتگی­ C=O… π از جمله برهم­کنش­های بین مولکولی هستند که موجب تشکیل ترکیب سوپرامولکولی بررسی شده­اند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Synthesis and crystal structure compound Adeninium Bis(pyridine-2,6-dicarboxylate) Chromate(III) pyridine-2,6-dicarboxylic acid tetra hydrate

نویسندگان [English]

  • Makan Etefagh 1
  • janet Soleimannejad 1
  • Sima Sedghiniya 1
  • Klodiya Graiff 2
1
2
چکیده [English]

A new supramolecular compound of adeninium bis(pyridine-2,6-dicarboxylate) Chromate(III) pyridine-2,6-dicarboxylic acid tetrahydrate (AdH+)[Cr(pydc)2](H2pydc).4H2O (1) (where Ad and H2pydc are adenine and pyridine-2,6-dicarboxylic acid, respectively) was synthesized via proton transfer method and its structure was determined using single crystal X-ray diffraction technique. This compound crystallizes in the orthorhombic crystal system with Pbca space group and the unit cell parameters are a = 14.180(14), b = 13.036(12),
c = 33.98(3) Å and α = β = γ = 90˚. The final R value is 0.053 for 2523 independent reflections. The asymmetric unit of compound 1 contains anionic, cationic and neutral species. The anionic part is a complex of Cr(III) with two coordinated pyridine-2,6-dicarboxylate groups and the cationic part is a protonated adenine. The neutral part has one molecule of pyridine-2,6-dicarboxylic acid and four hydration water molecules. The Cr(III)  atom in compound 1 adopts a distorted octahedral coordination geometry. All six coordination sites have been occupied by two deprotonated pyridine-2,6-dicarboxylate ligands. Non-covalent and intermolecular interactions i.e. Hydrogen bonds and C = O…π interactions are responsible for the self-assembled and regular structure of 1.

کلیدواژه‌ها [English]

  • supramolecular compounds
  • Proton transfer compounds
  • adenine
  • Hydrogen bonds
  • C = O…π interaction

مراجع

  1. [1] Solov'ev V. P., Tsivadze A. Y., "Supramolecular complexes: Determination of stability constants on the basis of various experimental methods." Protection of Metals and Physical Chemistry of Surfaces 51 (2015): 1-35. [DOI:10.1134/S2070205115010153]
  2. [1] Solov'ev V. P., Tsivadze A. Y., "Supramolecular complexes: Determination of stability constants on the basis of various experimental methods." Protection of Metals and Physical Chemistry of Surfaces 51 (2015): 1-35. [DOI:10.1134/S2070205115010153]
  3. [2] Toma H. E., Araki K., "Supramolecular assemblies of ruthenium complexes and porphyrins", Coordination Chemistry Reviews 196 (2000): 307-329. [DOI:10.1016/S0010-8545(99)00041-7]
  4. [2] Toma H. E., Araki K., "Supramolecular assemblies of ruthenium complexes and porphyrins", Coordination Chemistry Reviews 196 (2000): 307-329. [DOI:10.1016/S0010-8545(99)00041-7]
  5. [3] Beletskaya I., Tyurin V. S., Tsivadze A. Y., Guilard R., Stern C., "Supramolecular chemistry of metalloporphyrins." Chemical reviews 109 (2009): 1659-1713. [DOI:10.1021/cr800247a]
  6. [3] Beletskaya I., Tyurin V. S., Tsivadze A. Y., Guilard R., Stern C., "Supramolecular chemistry of metalloporphyrins." Chemical reviews 109 (2009): 1659-1713. [DOI:10.1021/cr800247a]
  7. [4] Lindsey J. S., "Self-assembly in synthetic routes to molecular devices. Biological principles and chemical perspectives: a review." ChemInform 22, (1991): 153-179. [DOI:10.1002/chin.199138328]
  8. [4] Lindsey J. S., "Self-assembly in synthetic routes to molecular devices. Biological principles and chemical perspectives: a review." ChemInform 22, (1991): 153-179. [DOI:10.1002/chin.199138328]
  9. [5] Chi X., Guerin A. J., Haycock R. A., Hunter C. A., Sarson L. D., "The thermodynamics of self-assembly." Journal of the Chemical Society, Chemical Communications 24 (1995): 2563-2565. [DOI:10.1039/c39950002563]
  10. [5] Chi X., Guerin A. J., Haycock R. A., Hunter C. A., Sarson L. D., "The thermodynamics of self-assembly." Journal of the Chemical Society, Chemical Communications 24 (1995): 2563-2565. [DOI:10.1039/c39950002563]
  11. [6] Yin H., Zhou Y., Ma Q., Ai S., Ju P., Zhu L., Lu L., "Electrochemical oxidation behavior of guanine and adenine on grapheme-Nafion composite film modified glassy carbon electrode and the simultaneous determination." Process Biochemistry 45, no. 10 (2010): 1707-1712. [DOI:10.1016/j.procbio.2010.07.004]
  12. [6] Yin H., Zhou Y., Ma Q., Ai S., Ju P., Zhu L., Lu L., "Electrochemical oxidation behavior of guanine and adenine on grapheme-Nafion composite film modified glassy carbon electrode and the simultaneous determination." Process Biochemistry 45, no. 10 (2010): 1707-1712. [DOI:10.1016/j.procbio.2010.07.004]
  13. [7] Verma S., Mishra A. K., Kumar J., "The many facets of adenine: coordination, crystal patterns, and catalysis." Accounts of chemical research 43, (2009): 79-91. [DOI:10.1021/ar9001334]
  14. [7] Verma S., Mishra A. K., Kumar J., "The many facets of adenine: coordination, crystal patterns, and catalysis." Accounts of chemical research 43, (2009): 79-91. [DOI:10.1021/ar9001334]
  15. [8] Marzotto A., Ciccarese A., Clemente D. A., Valle G., "Co-ordination chemistry of adenine (HAde): synthesis and characterization of [CuII (tren)(nucleobase)] X2 [tren= tris-(2-aminoethyl) amine, X= Cl or NO3] complexes and crystal structure of [CuII(tren)(Ade)]Cl•2H2O." Journal of the Chemical Society, Dalton Transactions 9 (1995): 1461-1468. [DOI:10.1039/DT9950001461]
  16. [8] Marzotto A., Ciccarese A., Clemente D. A., Valle G., "Co-ordination chemistry of adenine (HAde): synthesis and characterization of [CuII (tren)(nucleobase)] X2 [tren= tris-(2-aminoethyl) amine, X= Cl or NO3] complexes and crystal structure of [CuII(tren)(Ade)]Cl•2H2O." Journal of the Chemical Society, Dalton Transactions 9 (1995): 1461-1468. [DOI:10.1039/DT9950001461]
  17. [9] Sheldrick G. M., "SHELXTL Version 2014/7." Programs for the determination of small and macromolecular crystal structures by single crystal X-ray and neutron diffraction" University of Göttingen Germany. URL http://shelx. uni-ac. gwdg. de/SHELX/index. php (2014).
  18. [9] Sheldrick G. M., "SHELXTL Version 2014/7." Programs for the determination of small and macromolecular crystal structures by single crystal X-ray and neutron diffraction" University of Göttingen Germany. URL http://shelx. uni-ac. gwdg. de/SHELX/index. php (2014).
  19. [10] Macrae C. F., Bruno I. J., Chisholm J. A., Edgington P. R., McCabe P., Pidcock E., Wood P. A., "Mercury CSD 2.0-new features for the visualization and investigation of crystal structures." Journal of Applied Crystallography 41 (2008): 466-470. [DOI:10.1107/S0021889807067908]
  20. [10] Macrae C. F., Bruno I. J., Chisholm J. A., Edgington P. R., McCabe P., Pidcock E., Wood P. A., "Mercury CSD 2.0-new features for the visualization and investigation of crystal structures." Journal of Applied Crystallography 41 (2008): 466-470. [DOI:10.1107/S0021889807067908]
  21. [11] Tamilselvi D., Muthiah P. T., "Supramolecular patterns in benzyladeninium p-toluenesulfonate." Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure Communications 67.5 (2011): o192-o194. [DOI:10.1107/S0108270111013424]
  22. [11] Tamilselvi D., Muthiah P. T., "Supramolecular patterns in benzyladeninium p-toluenesulfonate." Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure Communications 67.5 (2011): o192-o194. [DOI:10.1107/S0108270111013424]

فایل ها

سابقه مقاله

  • تاریخ دریافت: 10 مرداد 1397
  • تاریخ بازنگری: 04 مهر 1397
  • تاریخ پذیرش: 09 آبان 1397

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار